تكمن مشكلة البحث: في جمع وتوضيح سؤالات عبد الله لأبيه ابن المديني في معرفة الصحيح من السقيم من الأحاديث النبوية، مع بيان علة الحديث. وقد جاءت هذه السؤالات في ثمانية مواضع من الأحاديث النبوية في جميع كتب الحديث، جمعتها ودرستها، وقد وردت جميعها بالأسانيد المتصلة في كتاب تأريخ بغداد للخطيب البغدادي، عدا موضعين فقط وردت في كتب الحديث الأخرى، وأن الإمام علي بن المديني لم يخالف أئمة النقد في الحكم على الأحاديث النبوية، ولكنه بيّنها بأسلوبه الخاص لأنه إمام كبير في علل الحديث.